No entendi muy bien la situacion pero aqui va mi idea de como se vee tu disco:
Disco 1:
Particion1: Ventanas XP (

GB)
Particion2: GNU/Linux / (raiz) (5MB)

?
Particion3: GNU/Linux /Home (5 GB)
Y antes te aparecia una ventana negra de windows que te decia:
Ventanas XP Profesional no se que
Ventanas XP Profesional no se que blablabla
Lamentablemente Ventanas no deja iniciar otro sistema que no sea Ventanas, aparte de grub hay otra serie de programas gestores de arranque que se instalan desde windows, tambien esta lilo pero a mi parecer el mejor sigue siendo grub, es muy configurable, puedes decirle que por default inicie Ventanas, o que espere solamente 2, 5, 10 segundos o los que quieras, puedes ponerle una imagen de fondo para que no sea solo la pantalla negra, puedes ponerle contraseña, en fin son muchas las ventajas que yo le veo a grub... Si te decides por otro gestor de arranque nos comentas cual...
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Por cierto la particion raiz requiere al menos 2 GB para funcionar correctamente y recomiendo 5 para instalar muchos muchos programas....